Предназначен для эффективного огневого поражения малоразмерных и площадных объектов в любое время года и суток, при любых метеоусловиях, без топогеодезического и метеорологического обеспечения.
 Основными объектами поражения ракетного комплекса «Искандер-Э» являются:
 - самолеты и вертолеты на стоянках аэродромов и в укрытиях;
 - батареи ЗРК противоракетной обороны;
 - пусковые установки ракетных комплексов в районах сосредоточения;
 - центры (посты) управления и оповещения ПВО (тактической авиации);
 - командные пункты армейских и корпусных подразделений;
 - мотопехотные, артиллерийские подразделения в районах сосредоточения, в том числе небронированная и легкобронированная техника;
 - стационарные высокозащищенные объекты типа энергоблоков электростанций;
 - склады боеприпасов;
 - объекты военно-промышленного потенциала, включая элементы топливно-энергетического комплекса.